第11独立機械化混成部隊による運用時には、ビーム・ライフルを使用したとの記録が確認されていないが、
機体のスペックから考えると十分に装備可能だったと判断できる。
なぜ装備していなかったのかという疑問に対する回答は諸説存在する。
当時、ビーム・ライフルは貴重で第11独立機械化混成部隊に回す余裕がなかったため、
地上戦においては大気によるビームの減退効果が著しく、実弾兵器の方が有効であると考えられたため、等である。

機体色のブルーはクルスト・モーゼス博士の趣味であるとされる。
その一方で、博士は「蒼」が格段に好きだというわけではなく、
「蒼」の塗装には何らかの特別な思いが掛けられているために為されたとも言われている。
なお、パイロットはテスト用のパイロットが複数いたとされるが、
最終的なパイロットであるユウ・カジマ中尉（当時）を除いて、全員死亡している。

なお、ユウ・カジマ中尉は、EXAMシステム作動中にたった1機でジオン公国軍基地を壊滅させたとある。
しかし、U.C.0079年12月15日に行われたキャリフォルニアベース掃討作戦において、
ジオン公国軍のEXAMシステム搭載MSイフリート改と交戦。
機体性能はブルー1号機の方が高く、辛くも勝利を収めたものの、
その際、EXAMシステムを搭載した頭部を破壊されてしまったため、1号機による実験は以後不可能となってしまった。

その後、頭部を失った1号機がどうなったのかは連邦軍内の記録から見つけ出すことはできない。
全く別の機体として使用されたか、廃棄処分されたか、
あるいは3号機の予備パーツとするべく分解されたかのいずれかであると思われる。

その他、宇宙での戦闘データの収集を目的としているため、バックパック等が宇宙戦仕様に交換されている。
それ以外に1号機との性能面での差はほとんどない。
1号機も宇宙用の換装を施せば2号機と同様の性能を発揮できたと思われる。
しかしながら、この2号機には1号機の専任メカニックであったアルフ・カムラ大尉がほとんど関わっておらず、
EXAMシステムの暴走を防ぐ役割を果たすリミッターは搭載されていない。
またクルスト・モーゼス博士の趣味によって1号機と同じく、2号機も全身を蒼く塗装されたと言われている。

パイロットは正式に決定されていなかったが、
ブルー1号機の性能を最大限に引き出していたユウ・カジマ中尉が予定されていたと考えられる。
しかし第11独立機械化混成部隊の中にはブルーディスティニーシリーズに対する羨望の眼差しを向ける者もおり、
予定通りユウ・カジマ中尉に決定したかどうかは不明である。
また、それ以前に事故によって2号機は失われてしまったため、パイロットの件も白紙に戻っている。
（詳細は以下参照）

＜事件詳細＞

地球連邦軍EXAM研究所（ハミルトン基地、ニュータイプ研究所）にて、
ブルー2号機の実験中、ジオン特殊部隊の襲撃を受け、2号機を強奪されてしまう。
その際、クルスト・モーゼス博士は特殊部隊の攻撃により死亡。
ブルー2号機はジオン公国軍のエースパイロット、ニムバス・シュターゼンの専用機となり、
両肩を血のように真紅に染められる。
これはニムバス・シュターゼン大尉のパーソナルカラーであった。

2号機の奪還、もしくは破壊の命を受けたユウ・カジマの駆るブルー3号機とサイド5付近の暗礁空域にて交戦。
相討ちとなり、ブルー2号機は大破。
パイロットであるニムバス・シュターゼンも死亡した。
その後、2号機は3号機とともに消息不明となっている。

ブルー2号機の奪回、もしくは破壊の命を受けたユウ・カジマが搭乗し、
ジオン公国軍のエースパイロット、ニムバス・シュターゼンと死闘を繰り広げる。
結果またしても相討ちとなり、ブルー2号機、3号機共に大破。
パイロットのニムバス・シュターゼンは死亡したが、ユウ・カジマは奇跡的に一命を取り留め、部隊の仲間に救助されている。
その後ブルー3号機の捜索も行われたが、発見には至らなかった。

EXAMシステムを搭載したMSが全て失われたため、以後、地球連邦軍においてEXAMの研究が行われることはなかった。
しかし、EXAMシステムの研究が地球連邦軍にもたらした影響は大きく、
EXAMの研究に関わったスタッフたちは後のニュータイプ研究所へと引き抜かれていき、その後のニュータイプ研究の礎となるのであった。

余談ではあるが、ブルー3号機には2種類のシールドが確認されている。
1つはジム・コマンド等の機体が装備していた防御面に優れたLサイズシールド。
もう1つは陸戦用先行試作型ガンダム等が装備していた突撃による攻撃が可能な凸型シールドである。

ジオン公国軍の勢力圏拡大が懸念される戦線へ優先的に配備されており、
設立当初から第11独立機械化混成部隊に配備されていたMSである。
また、同様の理由で東南アジア方面の部隊にも配備されていたことが確認されている。

宇宙戦の装備を施した機体も存在し、RGM-79(E)と表記される。
ルナツーにおいて試験的に少数が配備されていたようで、若干の戦闘記録も残されているが、戦果の方は芳しくなかったらしい。

ガンダムの教育型コンピュータに蓄積されたデータを導入することができたため、
新米パイロットでもMS戦闘においてある程度の戦果を残すことができた。
ジオンにMS開発で遅れを取っていた連邦においては、
パイロットの育成もまたジオンに水をあけられていたのだが、
これによってその問題がほぼ解消され、一年戦争勝利に結びつく要因ともなった。
一方のジオンは戦局が悪化するにつれ、開戦時からのベテラン兵を次々と失い、
戦争末期の高性能MSの性能を活かすだけの人材を育てることができなかった。

ソロモン、ア・バオア・クー攻略作戦においてユウ・カジマ、フィリップ・ヒューズ、サマナ・フュリスが搭乗した。
（近年、ア・バオア・クー戦では、彼らはRGM-79GS ジム・コマンドに搭乗したとする説が有力となっている。）
ジャブロー防衛戦においては、パク准尉がこの機体に搭乗し活躍した。
その結果、彼はユウ・カジマたちの第11独立機械化混成部隊に転属となる。

さらに第11独立機械化混成部隊のエースパイロット、ユウ・カジマはその後のア・バオア・クー攻略戦において
胸部装甲を蒼く塗装したRGM-79GS ジム・コマンドで出撃したとする逸話や、
同僚のフィリップ・ヒューズは、同作戦において本機の宇宙戦仕様で
ジオン公国軍のエース、ジョニー・ライデンと交戦したなどの逸話がある。
彼らがア・バオア・クー攻略戦において使用した機体はジムであったとされているが、
当時、これらのジムシリーズは数多くのバリエーションが生まれた上、
その全てを一貫してジムと呼称していた傾向があり、
このように多種に渡る説やエピソードが生まれたものと考えられる。

本来は後方からの支援射撃が主な役割だが、作業用アームで接近戦を行うつわものも存在したらしい。
また、一部の兵士の間のうわさでは、ボールの格闘戦でザクII（通常のものとは異なるとの説もあり）を撃破した記録もあるという。
フィリップ・ヒューズ少尉やサマナ・フュリス准尉はそれを知った上で行動した確信犯なのだろうか？

旧型のEXAMシステムを使用しているため冷却装置を搭載せねばならず、そのため頭部が肥大化している。
そもそも、イフリートは接近戦を重視して作られた機体であったため、
機動性は当初より高かったのだが、（地上戦ではゲルググよりも高い運動性を備えていたとの説もある）
EXAMシステムの搭載によって、その運動性能は飛躍的に上昇することとなった。
そのあまりの運動性のため、並大抵のパイロットでは扱えなかったとされる。
また、ミサイル類も装備することで接近戦以外の攻撃力も上昇している。

パイロットはニムバス・シュターゼン大尉で、地球連邦に亡命したクルスト・モーゼス博士の拘束もしくは抹殺、
および地球連邦軍のEXAM研究データの奪取もしくは破壊の任を受けていた。
ブルー1号機を輸送中のミデアを発見し、これを撃墜することに成功したが、
墜落直前にミデアが呼んだ応援部隊に阻まれ、ブルー1号機を破壊することはできなかった。
そして、キャリフォルニアベース防衛戦の際、そのブルー1号機と交戦し、敗北するが、
ニムバス・シュターゼンの執念による攻撃で、ブルー1号機の頭部を破壊することに成功する。
その後、機体は爆発炎上し失われた。

ユウ・カジマがコロニー内において交戦したザクIは一切の武装が為されていなかったのだが、
狭い空間において行動を制限された戦いにおいては、ザクIの格闘戦は脅威であった。
もっとも、距離を取っての射撃戦に持ち込まれては、ザクIには為す術がなかったのだが。

ブルー2号機追撃の際、ジオンのシャトル基地にて交戦。
その際、フィリップ・ヒューズ少尉、サマナ・フュリス准尉は愛機であるジムを撃破されてしまう。
直後、ジオン公国軍の部隊による反撃があり、シャトル基地に残されていたザクIIを緊急に使用することとなる。
識別コードは地球連邦軍のものに変更されていたが、吹雪のため視界が悪く、
さらにはその姿ゆえに、ユウ・カジマはこの戦闘に神経をすり減らすこととなった。
以降、部隊が宇宙に上がった際、この機体を持っていかなかったことから、彼らが搭乗したのはJ型であると推察できる。
あるいは、余計なMSを運ぶ余裕がなかっただけかもしれない。
仮にそうだとすると、このとき搭乗した機体がMS-06F、MS-06F2のいずれかである可能性もある。

ブルー1号機の機動性を前にしては自慢の格闘性能の高さも披露できずに終わった。
自暴自棄になったのか、奇策だったのか、
パイロットは本機でブルー1号機に対して飛び蹴りを行ったとの記録が残されている。

が、その常識を覆したのは後に『蒼い稲妻』と呼称されるユウ・カジマであった。
彼は基地の防衛システムが疲弊し、全くの支援が受けられない状況下において
冷静な状況判断、的確な戦闘行動によって3機のドムをたった1機のジムで撃破してしまったのである。
ユウ・カジマはこれをもって中尉に昇進し、部隊の仲間からは『エースパイロット』と呼ばれることになる。

第11独立機械化混成部隊が機体整備のために駐留していた連邦軍基地 （地中海沿岸）に襲撃をかけ、
基地施設に著しい被害をもたらしたものの、作戦による制限があったためか、水中戦ではなく地上戦を挑み、
ユウ・カジマの駆るたった1機のジムに3機とも各個撃破されてしまう。

だが、その高い陸戦能力もブルー1号機を前にしては意味を為さなかった。
水中戦ならば分もあったろうが、生憎基地近辺にお得意のホームグラウンドは存在しなかったらしく、
また存在したとしても基地の破壊が主目的のブルー1号機はその誘いにも乗らなかっただろう。